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了，横沟赞叹，“推理得太精彩了，千水！这个案件能够破解还真多亏了你啊！”千钧谦虚，“哪里哪里，其实我只不过比新一稍逊一筹而已，哈哈……”柯南好笑，“这家伙脸皮可真厚。”博士道，“倒是我们来这里拿的那张软盘，现在是不是可以给我了？”横沟道，“那可不行。凡是证物我们都要带回警局调查。”博士发愁，“这可怎么办？”柯南道，“没办法，今天只能就此作罢了。”千钧拜托横沟在案件调查完后将软盘还给博士，横沟答应了。博士道，“那我们回去啦，警官。”横沟挥手，“一路好走。”
走到门口，柯南招呼灰原，“好了，灰原。你也快走啊。”千钧发现灰原的脸色不对劲，灰原似乎很悲伤，“为什么？为什么你们当时没有救我的姐姐？”柯南纳闷，“你姐姐？”灰原的眼中都是泪水，“还不明白吗？广田雅美是广田教授为我姐姐取的一个假名。”柯南吃惊，“啊，那个10亿元抢劫案件中的广田雅美就是……”千钧却是知道，“她就是灰原的姐姐宫野明美。”柯南有些明白了，“怪不得你当时那么伤心。”柯南记得广田雅美卷入了地下组织的暗战中，在那次会见某个组织的人时死亡。
灰原很激动，“你这么有推理能力，千钧的功夫又如此了得，以你们的力量很容易救出我姐姐，可是……可是……为什么……”千钧弯下腰，“对不起，那天等我赶到的时候，已经太晚了。”灰原扑在千钧怀里大哭起来。她哭得声嘶力竭，将那件大家似乎已经忘却的悲惨事件又重新唤回来。千钧本想告诉她真相，但还是忍住没有说，“小哀，你要好好活下去。也许你的姐姐正在默默地关注着你，爱护着你。”灰原的泪水打湿了千钧的衣襟，也许那是她第一次如此的失态。
等4人在凌晨3点回到阿笠博士家，看见梅琴雨音竟然站在门口，不停地在翘首相望。博士吃惊，“梅琴小姐，你一直等在这里吗？”梅琴见到灰原平安，松了口气，将灰原抱住，“小哀，你没事就太好了。我还以为……真是的，千钧，你和博士出去带着小哀干什么，她才多大，如何能熬夜呢？”灰原伏在梅琴怀里，非常安详，“谢谢你，梅琴姐姐。”梅琴一愣，“傻瓜，你怎么了？咦，好像哭过？谁欺负你了……”说着话，博士将门打开，众人走入里面。
梅琴安慰灰原，“小哀，饿了吗？想吃什么……真是的，这么晚了，竟然还没吃晚饭……”梅琴一边去下厨，一边将博士和千钧批了个狗血喷头。柯南道，“喂喂，她未免热心过头了吧？”灰原轻笑，“要你管！”千钧头疼，“我就知道会这样。”博士发苦，“这里好像是我家，梅琴小姐怎么天天往这里跑？”灰原嘴角露出诡异的寒意，“怎么，你有意见？”博士汗，“没有，我只是随口说说，哈哈哈……其实梅琴小姐的手艺还真不错，比去外面吃餐厅好太多了……”柯南嘲讽，“喂喂……算了，我的肚子也饿了。”吃完饭后，看到灰原睡着后，梅琴和千钧才一起离开。回去的路上，千钧将广田教授发生的事情告知了梅琴。梅琴唏嘘不已，“没想到广田教授竟然这样死了，他对我颇为照顾的。”
尾声，白仓阳因口角杀死广田正巳，被法庭判处6年徒刑。千钧因破获大学教授密室事件，静冈县警署给以了B级奖励。这件事情并没有引起媒体的广泛报道，主要是因为这个时间段火灾系列的案件太多了，这个杀人事件就不那么显眼。梅琴责怪千钧，“去那么危险的地方，还带着小哀！”千钧也很无奈，“是小哀非要一起去的。还好，我们很小心，没出什么意外。”不过，梅琴也发现了有组织的外围人员在寻找妹妹，“看来，我们姐妹暂时还不便相认。”千钧也道，“希望他们不会注意到小孩这个层次。你尽量不要跟小哀一起在外面出现。在家里没有外人的话，倒没有关系。”
一个星期后，警方将软盘还给了阿笠博士。大家打算立即用博士的电脑进行查询。博士道，“没想到软盘竟然通过了警方的检查。”灰原道，“由组织所配给的软盘，如果没有输入特地的密码，就只是单纯的文书资料。他们是不可能怀疑的。”千钧提醒道，“小心有病毒。”这句话提醒了灰原，“看来我们需要一台单独的电脑来解密，还要防止中毒。”阿笠博士道，“这个我比较在行，电脑我也有备用的。”由于经济条件的改善，博士的生活条件也大大提高了。
经过博士的一番处理，“这样，就算有病毒也不会销毁所有的资料。”接着屏幕上出现输入密码的对话框，灰原上前输入密码。里面不仅仅有药品资料，还有进入那个研究所之前的所有参与药品开发人员的真名和地址，以及代号全部在上面。就连出资赞助的人名都有记录。柯南大喜过望，“如果顺利的话，说不定可以揭穿他们的真实身份。”可是随后电脑出现异常，博士大惊，“怎么会这样？”千钧看出来，“这是病毒啊！”灰原道，“病毒叫做暗夜男爵。”
黑色保时捷，伏特加报告，“大哥，广田那个老头已经死了。”琴酒叼着烟，“那也省了我们的一番功夫。”伏特加道，“不过，那个消失的女人到现在也没有任何消息，我们已经尽力了。”琴酒道，“现在组织的内部正在排查，这次有没有什么人，帮助这个女人逃脱。而且她所有能去的地方，都被我们毁掉了。要不了多久，她就会露出狐狸尾巴来的。”伏特加担心，“大哥，那个药品软盘听说已经被警方扣留查验了。”琴酒笑道，“不用担心，那张软盘上面我们做过手脚。”
随后，二人来到一个秘密据点，得到了组织老大传来的命令，是电话声音，让二人立即隐蔽起来不要再行动，“山本一夫又破获了我们的一个关键基地。组织有部分人员落入秘密调查局手中。你们的行动太招摇了，尤其是你，琴酒！如果再出岔子，你应该知道会有什么结果。而且山本已经知道我们在寻找一个女研究人员，幸好他还并不知道雪莉的具体情况。”琴酒无可奈何，“那我们暂时离开东京一段时间吧。这个山本，真是可怕的对手啊！”伏特加只好道，“寻找雪莉的事情只好先放下了。”
大名鼎鼎的暗夜男爵病毒，只要发现软盘不是在特定的电脑上打开，就会产生不可挽救的程序。柯南抱怨，“博士，你不是采取措施了吗？”博士擦汗，“我没想到是这个病毒，这下子糟糕了。”柯南问道，“那所有的资料？”灰原叹气，“差不多全破坏了，只剩下研究药物的部分资料。博士的预防措施还是起到了一点作用。”千钧道，“那能用来做研究吗？”灰原苦笑，“你说呢？资料残缺严重，脱节又太多，只能慢慢来。”柯南大叫可恶，千钧道，“也不是一无所获，我们至少得到了部分资料，不是吗？”灰原道，“看来我要跟柯南继续相处一段时间了。”千钧道，“我好想看看你长大后的样子……”灰原也无奈，“我也想啊！可想要恢复真身，还需要更长的时间来进行研究。你就再忍忍吧，大色狼！”